Thor, babası ile barışıp çekicini geri aldıktan ve Asgard'a geri dönmeye hak kazandıktan sona bu kez de Dark Elves isimli bir güçle mücadele etmek zorundadır. Malekith isimli bir lideri olan bu örgüt Dünya'yı ve diğer 9 diyarı yok etmek istemektedir. Bu güç karşısında Odin ve Asgard bile duramamıştır. Malekith'i ve askerlerini durdurma görevi ise böylece Thor'un omuzlarına bırakılmıştır. Ancak Thor'un, Dünya'daki dostlarını, evini ve bütün dünyayı kurtarmak için bu kez feda etmesi gereken şeyler vardır.
